ในสิ่งที่นักวิทยาศาสตร์บางคนอธิบายว่าเป็นนวัตกรรมที่กว้างขวางที่สุดในการจัดลำดับยีนในช่วง 25 ปีที่ผ่านมา นักวิจัยได้พัฒนาเครื่องมือที่สามารถอ่านตัวอักษรทางพันธุกรรมของ DNA ได้เร็วกว่าเทคนิคมาตรฐานถึง 100 เท่าลูกบอลและโซ่ แผงแสดงวิธีการที่ตัวอย่าง DNA ติดอยู่กับเม็ดบีด ซึ่งตกตะกอนในหลุมในจานที่เต็มไปด้วยเม็ดบีดเคลือบเอนไซม์ขนาดเล็ก กิจกรรมของเอนไซม์เผยให้เห็นลำดับเบส-คู่ของตัวอย่าง
M. MARGULIES ET AL./ธรรมชาติ
“มันมีศักยภาพที่จะเปลี่ยนวิธีที่เราทำสิ่งต่าง ๆ กับจีโนมได้จริงๆ” เอช. แชด นุสบาม ผู้อำนวยการร่วมของการจัดลำดับจีโนมและการวิเคราะห์ที่ Broad Institute ซึ่งเป็นศูนย์วิจัยทางพันธุกรรมที่ดำเนินการร่วมกันในเคมบริดจ์ รัฐแมสซาชูเซตส์ โดยมหาวิทยาลัยฮาร์วาร์ดและ สถาบันเทคโนโลยีแมสซาชูเซตส์
รับข่าววิทยาศาสตร์ในกล่องจดหมายของคุณ
ล่าสุดและยิ่งใหญ่ที่สุดจากนักเขียนผู้เชี่ยวชาญของเราทุกสัปดาห์
ที่อยู่อีเมล*
ที่อยู่อีเมลของคุณ
ลงชื่อ
แนวทางใหม่ที่พัฒนาโดย 454 Life Sciences Corp. ในแบรนฟอร์ด รัฐคอนเนตทิคัต ก้าวข้ามปัญหาคอขวดในการจัดลำดับยีนแบบเดิม ในเครื่องจักรที่ใช้โครงร่างนั้น หรือที่เรียกว่าวิธี Sanger สามารถจัดลำดับ DNA ได้เพียง 96 สายต่อครั้งเท่านั้น ตอนนี้ Jonathan M. Rothberg จาก 454 Life Sciences และเพื่อนร่วมงานของเขาได้จัดลำดับตัวอย่างดีเอ็นเอหลายแสนตัวอย่างพร้อมๆ กัน งานนี้ได้อธิบายไว้ในNature ที่กำลังจะ มา ถึง
ด้วยวิธีใดวิธีหนึ่ง ช่างเทคนิคจะสับ DNA ออกเป็นส่วนๆ
ก่อน ลำดับต่อไป Sanger ทำให้ส่วนในแบคทีเรียสำหรับการจำลองแบบ นำออกจากแบคทีเรียแล้วสำเนาเหล่านั้นจะได้รับการจำลองแบบเพิ่มเติมและติดแท็กเรืองแสง ในที่สุด พวกมันจะถูกป้อนเข้าไปในอุปกรณ์ 96 หลอดที่แสดงลำดับของคู่เบสแต่ละคู่ที่ประกอบกันเป็นส่วนของ DNA
การจ่ายแบคทีเรียทั้งหมด แนวทางของ 454 Life Sciences ใช้กระบวนการในหลอดทดลองเพื่อเคลือบไมโครสโคปบีดแต่ละแสนเม็ดด้วยส่วนดีเอ็นเอ ลูกปัดแต่ละเม็ดมีสำเนาหลายล้านชุดในหนึ่งส่วน ถัดไป เม็ดบีดแต่ละเม็ดจะถูกฝากไว้ในหลุมเล็กๆ ของตัวเองในแผ่นขนาดเท่าบัตรเครดิตซึ่งตรวจสอบโดยอาร์เรย์รับแสงหนาแน่นที่ป้อนข้อมูลไปยังคอมพิวเตอร์ เมื่อปฏิกิริยาเคมีเกิดขึ้นในแต่ละหลุม จะทำให้เกิดแสงวาบซึ่งบ่งบอกว่าคู่เบสใดอยู่ในส่วนนั้น
สมัครสมาชิกข่าววิทยาศาสตร์
รับวารสารวิทยาศาสตร์ที่ยอดเยี่ยมจากแหล่งที่น่าเชื่อถือที่สุดส่งตรงถึงหน้าประตูคุณ
ติดตาม
วิธีการของแซงเจอร์จัดลำดับส่วนดีเอ็นเอที่มีคู่เบส 800 คู่เป็นประจำ ในขณะที่รายงาน 454 Life Sciences อธิบายการจัดลำดับส่วนคู่เบสเพียง 100 คู่ เจน โรเจอร์ส หัวหน้าฝ่ายจัดลำดับจีโนมของ Wellcome Trust Sanger Institute กล่าวว่า เนื่องจากเป็นการยากกว่ามากในการไขปริศนาจีโนมที่สมบูรณ์จากส่วนที่สั้นกว่า วิธีการใหม่นี้จึงมีประโยชน์จำกัดในการวิเคราะห์จีโนมขนาดใหญ่ที่ซ้ำกัน เช่น จีโนมของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม ฮินซ์ตัน ประเทศอังกฤษ
Rothberg บอกกับScience Newsว่าทีมของเขากำลังปรับเปลี่ยนวิธีการเพื่อให้ใช้ได้กับเส้นใยที่ยาวขึ้น ทีมงานได้จัดลำดับส่วนฐาน 500 ฐานแล้ว เขากล่าว
แม้ว่าเครื่องจักร 454 Life Sciences จะมีราคาครึ่งล้านดอลลาร์ ซึ่งมากกว่าอุปกรณ์ทั่วไปประมาณ 150,000 ดอลลาร์ แต่ปริมาณงานที่สูงขึ้นจะช่วยลดต้นทุนการจัดลำดับ Rothberg กล่าว
การลดต้นทุนการจัดลำดับเป็นเป้าหมายหลักของนักพันธุศาสตร์ เทคโนโลยีปัจจุบันสามารถสะกดจีโนมของบุคคลหรือรหัสพันธุกรรมทั้งหมดได้ในราคาเกินกว่า 10 ล้านดอลลาร์ ตามข้อมูลของ Geoff Spencer จากสถาบันจีโนมมนุษย์แห่งชาติในเบเธสดา รัฐแมริแลนด์ การลดราคาลงอย่างมากอาจทำให้แพทย์มีความเป็นไปได้มากขึ้น กำหนดแนวโน้มของแต่ละบุคคลสำหรับโรคบางอย่าง
แม้ว่า Rothberg และเพื่อนร่วมงานของเขาจะเป็นกลุ่มแรกที่นำผู้เข้าแข่งขันด้วยวิธี Sanger เข้าสู่ตลาด แต่กลุ่มอื่นๆ จำนวนมากกำลังพัฒนาผู้ท้าชิง ตัวอย่างเช่น ในงาน Scienceที่กำลังมาถึงJay Shendure จาก Harvard Medical School ในบอสตันและเพื่อนร่วมงานของเขารายงานเครื่องหาลำดับเบสต้นทุนต่ำที่พวกเขาสร้างขึ้นด้วยงบประมาณ 140,000 ดอลลาร์
“เกมเทคโนโลยีการจัดลำดับแบบใหม่คือการแข่งม้า” นุสบามกล่าว “454 อยู่ข้างหน้าในตอนนี้” เขากล่าว แต่ยังไม่มีใครรู้ว่าใครจะเป็นผู้ชนะหรือผู้ชนะในที่สุด
credit : partyservicedallas.com
veslebrorserdeg.com
3gsauron.com
thebeckybug.com
thedebutantesnyc.com
antonyberkman.com
welldonerecords.com
prestamosyfinanciacion.com
nwiptcruisers.com
paleteriaprincesa.com
dessert-noir.com
